Les truites du ruisseau de la Mousquère s'alimentent essentiellement à partir de la dérive ; il y a cependant un certain choix sur le fond, notamment en ce qui concerne les Trichoptères. La faune d'origine exogène joue un rôle important dans la nutrition, au moins en été.

Des pêches ont été effectuées en 2 secteurs. Le taux de croissance est supérieur dans le secteur où la densité est moindre. Pour chaque classe d'âge, le coefficient K est en rapport inverse avec la densité. Il en résulte que la biomasse et la production annuelle sont comparables dans les deux secteurs étudiés, et que la nourriture disponible paraît être le facteur limitant la population. Il y a un déséquilibre entre les individus jeunes et ceux de 3 ans et plus, trop nombreux.