Une série de dragages effectués dans la Saône au niveau de 13 stations réparties sur 377 km de rivière montre que le macrobenthos du chenal de cette rivière est, dans les stations les moins dégradées, largement dominé par les Ephéméroptères fouisseurs (Ephoron virgo et Ephemera lineata). La comparaison avec le macrobenthos du Haut-Rhône indique que ce dernier, qui présente des caractéristiques mésologiques et hydrologiques similaires, se situe typologiquement plus à l'amont que la Saône. La durée et l'importance de l'étiage combinées avec les différences de pente, cette dernière influençant la vitesse du courant et la granulométrie, sont probablement les facteurs essentiels qui structurent les peuplements macrobenthiques de ces deux cours d'eau.