L'analyse des sédiments de quinze stations de l'Ill et de ses affluents a révélé l'existence de contaminations par les métaux lourds qui sont associées, dans la majorité des sites prospectés, à une forte charge en matières organiques. Les peuplements d'oligochètes inféodés aux sédiments fins sont dominés par des espèces résistantes à la pollution (Limnodrilus hoffmeisteri, Tubifex tubifex, Pristinella jenkinae...) ou ubiquistes (Aulodrilus pluriseta). Les fortes contaminations métalliques des sédiments sont généralement associées à des valeurs de l'indice oligochètes IOBS ≤ 1 et à des effectifs ≤ 1000.0,1 m-2. Elles sont corrélées négativement avec le pourcentage de Tubificidae avec soies capillaires et positivement avec le pourcentage de Tubificidae sans soies capillaires. Les métaux semblent perturber la reproduction in situ des oligochètes. Les adultes de Tubificidae sont en général moins résistants que les immatures et la stratégie de reproduction par voie asexuée pourrait constituer un facteur de résistance aux contaminations métalliques.