Les proliférations de macrophytes atteignent désormais les eaux courantes et entraînent de nombreuses nuisances. La compréhension de ce phénomène nécessite une étude approfondie des peuplements végétaux en place et des paramètres d'environnement qui les conditionnent, afin de déterminer les phytocénoses de référence et leurs séquences de dégradation. Lors de cette étude, vingt et un cours d'eau, situés en tête de bassin versant et représentatifs de la diversité géologique de la Lorraine, ont été prospectés. Le choix des stations d'étude a été réalisé en fonction d'un découpage abiotique, définissant des zones de cours d'eau homogènes au niveau de la géologie, la pente et la largeur. La pertinence de l'utilisation de la géologie (classes de perméabilité) comme premier critère hiérarchique de classification des cours d'eau est confirmée par les résultats de cette étude. Les analyses chimiques et les relevés morphométriques effectués sur chaque station d'étude ont conduit à individualiser quatre grands types de cours d'eau (sur granites, sur grès, sur calcaires et sur marnes), dont la végétation aquatique a été inventoriée. Des successions végétales typiques en fonction de la position amont-aval ont été observées. Les notions de milieux naturellement fragiles et d'espèces « à risque de prolifération » ont été affinées. Cette étude constitue la base d'une typologie des cours d'eau par la végétation aquatique.