Depuis une trentaine d'années, le Centre de Physique Atomique de Toulouse a développé des codes de calcul du transport des particules dans la matière et plus particulièrement ces dernières années il s’est orienté vers l’étude des risques biologiques des rayonnements. Ce papier décrit les différentes étapes physique, physico-chimique et chimique de la simulation jusqu’à environ une microseconde pour évaluer les distributions des dommages initiaux à l’origine des désordres radiobiologiques subséquents. Deux exemples de calcul des dommages à l’ADN sont exposés : 1) dommages causés par des rayons X ultra mous et 2) complexité des dommages causés par l’émission Auger et la fluorescence dues à la réorganisation interne dans le cisplatine après photoactivation de la couche K du platine.
